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对SBR处理工艺而言，运行周期的确定还与沉淀、排水排泥时间及闲置时间有关，还和处理工艺中所设计的SBR反应器数量有关。运行周期的确定除了要保证处理过程中运行的稳定性和处理效果外，还要保证每个池充水的顺序连续性，即合理的运行周期应满足运行过程中避免两个或两个以上的池子同时进水或第一个池子和最后一个池子进水脱节的现象。同时通过改变曝气时间和排水时间，对污水进行不同的反应测试，确定的运行模式，达到的出水水质、最经济的运行方式。
（三） 污泥沉降性能的控制
活性污泥的良好沉降性能是保证活性污泥处理系统正常运行的前提条件之一。如果污泥的沉降性能不好，在SBR的反应期结束后，污泥难以沉淀，污泥的压密性差，上层清液的排除就受到限制，水泥比下降，导致每个运行周期处理污水量下降。如果污泥的絮凝性能差，则出水中的悬浮固体（SS）含量将升高，COD上升，导致处理出水水质的下降。
离子交换法
离子交换法是利用多孔性的阴离子交换树脂，选择性地吸收去除污水中的磷去除磷。但是存在着一系列问题，比如树脂药物易中毒、交换容量低和选择性差等，因而这种方法难以得到实际应用。
吸附法除磷
吸附法主要是利用某些多孔或大比表面的固体物质对水中磷酸根离子的吸附亲和力来实现对废水的除磷过程。制备适用的高效吸附剂是吸附法除磷的关键，已经有很多学者对天然材料和炉渣的吸附脱磷性能进行了。利用天然沸石复合吸附剂处理含磷废水，效果较好。吸附法除磷作为一种从低浓度溶液中去除特定溶质的高效低耗方法，特别适用于废水中有害物质的去除。在利用药品进行饱和吸附剂再生过程中，可能会造成污水，不能直接排放，在应用上存在困难。
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导致污泥沉降性能恶化的原因是多方面的，但都表现在污泥容积指数（SVI）的升高。SBR工艺中由于反复出现高浓度基质，在菌胶团菌和丝状菌共存的生态环境中，丝状菌一般是不容易繁殖的，因而发生污泥丝状菌膨胀的可能性是非常低的。SBR较容易出现高粘性膨胀问题。这可能是由于SBR法是一个瞬态过程，混合液内基质逐步降解，液相中基质浓度下降了，但并不完全说明基质已被氧化去除，加之许多污水的污染物容易被活性污泥吸附和吸收，在很短的时间内，混合液中的基质浓度可降至很低的水平，从污水处理的角度看，已经达到了处理效果，但这仅仅是一种相的转移，混合液中基质的浓度的降低仅是一种表面现象。可以认为，在污水处理过程中，菌胶团之所以形成和有所增长，就要求系统中有一定数量的有机基质的积累，在胞外形成多糖聚合物（否则菌胶团不增长甚至出现细菌分散生长现象，出水浑浊）。在实际操作过程中往往会因充水时间或曝气方式选择的不适当或操作不当而使基质的积累过量，致使发生污泥的高粘性膨胀。
化学(http://www.maoyihang.com/sell/l_9/)凝聚沉淀法
化学凝聚沉淀法主要是将易溶于水的某些金属盐投入水中，金属离子与磷反应生成一种难溶性盐与水体分离，以此除去水中的磷。磷的去除率在75%左右[1-3]，处理效果稳定，系统操作简便，易于自动化，抗冲击性强，对管理人员的要求不是很高。因此，它成为目前应用最普遍的除磷方法。但由于人为投加了化学药剂，造成水处理费用的增高，并产生大量的污泥，且难于处理;如果填埋，则需要较大场地;如果焚烧则费用很高。上海的白龙港污水处理厂一期工程(旱季120万m3˙d-1，雨季188.8万m3˙d-1)和竹园第一污水处理厂(旱季170万m3˙d-1，雨季426.1万m3˙d-1)即采用化学凝聚沉淀除磷作为强化一级处理。
